Enfrentar a Colo Colo por Libertadores trae un grato recuerdo a la afición de Junior. La única vez que lo hizo, avanzó y ese año fue semifinalista en el certamen.
Es la mejor participación del equipo en el certamen continental de mayor relevancia en la Conmebol. Hoy, 30 años después, volverá a cruzarse con el cuadro chileno en la misma instancia (octavos de final). Busca superar lo hecho en aquella ocasión. Y para eso, lo primero estuvo en superar la fase de grupos nuevamente tras 13 años. Ahora viene el reto ante Colo Colo que arranca en territorio chileno.
La única vez de Junior visitando a Colo Colo
Era el Junior que dirigía Julio Comesaña en 1994. Superó la fase de grupos en la que compitió con el DIM, Olimpia y Cerro Porteño. La siguiente fase la jugó ante un Colo Colo que tenía como DT interino a Eddio Inostroza. La llave empezó en Barranquilla con empate 1-1 y se cerró en Chile con otra igualdad (ahora 2-2, goles del Niche Guerrero y Luis Grau). Se definió en penaltis y avanzó el equipo colombiano que posteriormente volvió a cruzarse con el DIM (cuartos de final) y en la semifinal perdió con Vélez Sarsfield.
Aquel Junior en Chile jugó con: José María Pazo; Gober Briasco, Luis Grau, Alexis Mendoza, Héctor Méndez (Carlos Araujo), Luis Grau; Alfredo Nieto, Víctor Danilo Pacheco, Carlos Valderrama; Miguel Guerrero (José Hernández) e Iván René Valenciano. DT. Julio Comesaña.
El otro par de visitas de Junior a equipos chilenos en Libertadores
Febrero de 2012 (fase de grupos): Unión Española 2-0 Junior (Emanuel Herrera y Fernando Cordero).
Febrero de 2012 (fase de grupos): Universidad Católica 2-2 Junior (Felipe Gutiérrez x 2); Vladimir Hernández y Héctor Quiñones).